В пятницу днем относительное затишье вокруг школы внезапно прекратилось. Сначала около 13-00 террористы согласились отдать тела заложников и началась эвакуация.
Одновременно за телами погибших к зданию школы отправился автомобиль. С интервалом в несколько минут стали один за другим греметь сильные взрывы и началась стрельба из крупнокалиберного оружия. Буквально через несколько минут из здания школы вырвались несколько заложников. Солдаты стали выносить заложников в безопасную зону. Стрельба шла около 20 минут. После этого люди в камуфляжной форме стали выводить женщин и детей. Некоторые дети были в крови. Заложники, выбегая, плакали. К школе сразу же подъехали машины «скорой помощи». Через несколько минут, в момент эвакуации тел погибших сотрудников МЧС, боевики подорвали ранее установленные в захваченной школе взрывные устройства. В результате взрывов произошло частичное обрушение крыши школы. Сразу же после этого дети стали выбегать из здания. Боевики начали вести беспорядочную стрельбу по людям и зданиям. Заложники — взрослые и дети — бежали прочь от школы, многие из них полуголые. По словам очевидцев, солдаты относили окровавленных детей от школы, некоторых — на носилках. В оперативном штабе утверждают, что происшедшее не было штурмом школы. Группа заложников вырвалась из здания, боевики начали расстреливать убегающих заложников, и военные вынуждены были открыть ответный огонь. Боевики пытались прорваться сквозь толпу родственников захваченных людей, солдаты этому препятствовали. Российские войска начали вести огонь по отступающим боевикам. «Интерфакс» утверждает, что большинство детей, оставшихся в школе, не пострадали. Был ранен корреспондент польского телевидения. Боевики предприняли попытку вырваться из школы в город. На 14-15 по московскому времени в больницах Беслана находилось 158 детей. В 14-25 в здание школы вошли медики с носилками. Милиция блокирует Беслан, чтобы не дать уйти боевикам. В 15-25 спецназ атаковал дом, в котором укрылись бежавшие из школы террористы.
